Hora del sistema y hora del hardware.
Era un problema frecuente: la hora de la BIOS y de Linux tenían un desfase de un par de horas. Para hacerlos coincidir:
hwclock --adjust (el ajuste se guarda en /etc/adjtime) hwclock --systohc
Debian: No hace falta, hace automáticamente al parar y arrancar, desde /etc/rc0.d/K25hwclock.sh y /etc/rcS.d/S18hwclockfirst.sh, respectivamente.
También se puede usar ntp (ntpd) http://www.eecis.udel.edu/~ntp/ incluso para sincronizar clientes windows http://www.unizar.es/ccuz/servicios/ntp/unix/rdate.html