Hoy en día, la gran mayoría de hardware está soportado por Linux, asi que no deberiais tener problemas. De todas maneras, existen configuraciones que no están soportadas y quizas últimos modelos de tarjetas gráficas, controladoras, etc, que tampoco lo estén.
Día a día se trabaja para dar soporte a nuevo hardware y lo que no este soportado hoy, probablemente está soportado muy pronto. En un pasado, muchas casas de productos no apoyaban a linux, con el consiguiente retraso en el soporte a estos productos, con respecto a otros sistemas operativos, pero ultimamente esto está cambiando rápidamente.
Si quereis comprobar si vuestro hardware esta soportado por linux o no, leer el Hardware-Howto, un documento con el hardware soportado por linux. También os podeis pasar por esta excelente web, Linuxhardware.net, donde podreis consultar sobre vuestro hardware.